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Dictionnaire analogique intriqué pour extraits. Recherche mots ou phrases tous azimuts. Aussi outil de précision sémantique et de réflexion communautaire. Voir la rubrique mode d'emploi. Jetez un oeil à la colonne "chaînes". ATTENTION, faire une REINITIALISATION après une recherche complexe. Et utilisez le nuage de corrélats !!!!..... Lire la suite >>

Nuage de corrélats

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dualité biologique

Au cœur du problème repose un paradoxe apparent : les protéines peuvent faire beaucoup de choses, mais elles ne peuvent pas remplir de fonction de stockage et transmettre des informations pour leur propre construction. D'autre part, l'ADN peut stocker des informations, mais ne peut rien fabriquer ni dupliquer lui-même. L'ADN a donc besoin de protéines et les protéines ont besoin de l'ADN. Un cycle apparemment insécable - problématique ultime de la poule et de l'œuf.

Auteur: Denton Michael J.

Info: Nature’s Destiny: How the Laws of Biology Reveal Purpose In the Universe. Part 2, Chapter 12 (p. 293). The Free Press, New York, New York, USA; 1998

[ micro-monde ] [ interdépendance ]

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hyper-complexité du vivant

La biologie moléculaire a montré que même les plus simples de tous les systèmes vivants sur terre aujourd'hui, les cellules bactériennes, sont des objets extrêmement complexes. Bien que les cellules bactériennes soient incroyablement petites, pesant moins de 10 à 12 gms, chacune est en fait une véritable usine micro-miniaturisée de conception exquise, qui contient des milliers de pièces et de machines moléculaires complexes, formées au total de cent milliards d'atomes, beaucoup plus compliquée que tout engin construit par l'homme et absolument sans équivalent dans le monde non vivant.

Auteur: Denton Michael J.

Info: Evolution: A Theory in Crisis. Chapter 11 (p. 250). Adler & Adler. Bethesda, Maryland, USA. 1986

[ nanomonde ]

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mécanisme biologique

L'impossibilité d'une transformation fonctionnelle progressive est une évidence dans le cas des protéines : une simple observation causale révèle qu'une protéine est un tout en interaction, la fonction de chaque acide aminé étant plus ou moins (comme les lettres d'une phrase ou les roues dentées dans une montre) essentielle à la fonction du système entier. Changer, par exemple, la forme et la fonction du site actif (comme modifier le verbe d'une phrase ou une roue dentée importante d'une montre) de façon isolée dans la molécule, déstabilisera tout le système le rendant inutilisable.

Auteur: Denton Michael J.

Info: L'évolution : Une théorie en crise. Chapitre 13 (p. 321) Adler & Adler. Bethesda, Maryland, États-Unis. 1986

[ complexité ] [ peptides ] [ analogie sémantique ]

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miguel

16.10.2024

(Gemini) - Voici quelques analogies sémantiques qui peuvent aider à mieux comprendre la relation entre les acides aminés et les protéines : Analogies basées sur la construction Les acides aminés sont aux protéines ce que les lettres sont aux mots: Chaque lettre de l'alphabet peut être combinée d'une infinité de façons pour former des mots. De même, chaque acide aminé peut être combiné de différentes manières pour former une multitude de protéines, chacune ayant une fonction spécifique. Les acides aminés sont aux protéines ce que les briques sont à un mur: Les briques sont les éléments de base d'un mur, et leur arrangement détermine la forme et la fonction du mur. De même, les acides aminés sont les éléments de base des protéines, et leur séquence détermine la structure et la fonction de la protéine. Analogies basées sur la fonction Les acides aminés sont aux protéines ce que les notes de musique sont à une mélodie: Chaque note de musique contribue à la mélodie globale, et l'ordre dans lequel elles sont jouées détermine la mélodie. De même, chaque acide aminé contribue à la fonction d'une protéine, et leur ordre dans la séquence détermine la fonction de la protéine. Les acides aminés sont aux protéines ce que les ingrédients sont à un plat: Les ingrédients sont les éléments de base d'un plat, et leur combinaison détermine le goût et la texture du plat. De même, les acides aminés sont les éléments de base des protéines, et leur combinaison détermine la fonction de la protéine. Analogie plus détaillée : la recette de cuisine Imaginez une recette de cuisine. Les ingrédients sont les acides aminés, et le plat final est la protéine. Chaque ingrédient a des propriétés spécifiques (sucré, salé, acide, etc.), tout comme chaque acide aminé a des propriétés chimiques spécifiques. L'ordre dans lequel les ingrédients sont combinés, ainsi que les quantités, déterminent le goût final du plat, tout comme l'ordre des acides aminés dans une protéine détermine sa fonction. En résumé: Les acides aminés sont les unités de base qui s'assemblent pour former les protéines. Tout comme les lettres forment des mots, les notes de musique forment une mélodie et les ingrédients forment un plat, les acides aminés, lorsqu'ils sont combinés dans un ordre spécifique, créent des protéines aux fonctions variées et essentielles à la vie. Ces analogies vous semblent-elles claires ? Souhaitez-vous d'autres exemples ? N'hésitez pas à me poser d'autres questions sur les acides aminés, les protéines ou la biologie moléculaire en général. (FLP) - peut-on dire que l'élément sous jacent au acides aminés sont les atomes ? (Gemini) - Les atomes sont bel et bien les éléments de base qui constituent les acides aminés. Pour mieux comprendre cette relation, imaginons une construction en Lego. Les Legos sont comme les acides aminés, et les petites briques qui composent les Legos sont comme les atomes. Tout comme on peut assembler différentes briques pour construire des structures complexes, on peut assembler différents atomes pour former des acides aminés. Plus précisément, les acides aminés sont composés principalement de cinq types d'atomes : Carbone (C): Il forme la colonne vertébrale de l'acide aminé. Hydrogène (H): Il est lié au carbone et aux autres atomes de l'acide aminé. Oxygène (O): On le retrouve dans le groupe carboxyle (-COOH). Azote (N): Il est présent dans le groupe amine (-NH2). Soufre (S): Il est présent dans certains acides aminés spécifiques, comme la méthionine et la cystéine. La combinaison spécifique de ces atomes et leur arrangement dans l'espace déterminent les propriétés de chaque acide aminé. Pour résumer: Les atomes sont les briques élémentaires de la matière. Les acides aminés sont des molécules constituées d'atomes. La séquence et la structure des acides aminés déterminent les propriétés des protéines qu'ils forment. En somme, les atomes sont bien l'élément sous-jacent aux acides aminés, tout comme les briques sont l'élément sous-jacent à une construction en Lego. Pourriez-vous me poser d'autres questions sur les acides aminés, les protéines ou la biologie moléculaire en général ? (FLP) - Peux-tu élaborer une analogie sémantique qui met en interaction ces 5 types d'atomes ? (Gemini) Voyons comment nous pouvons illustrer l'interaction de ces 5 types d'atomes (carbone, hydrogène, oxygène, azote et soufre) dans un acide aminé en utilisant une analogie : Analogie de la construction d'une maison Imaginez que vous construisez une maison très particulière, une maison qui a des fonctions très spécifiques. Chaque pièce de cette maison représentera un rôle différent dans la structure d'un acide aminé. Les fondations (Carbone): Le carbone est l'élément central, la colonne vertébrale de l'acide aminé. Il forme la structure de base et relie tous les autres éléments entre eux, comme les fondations d'une maison supportent tout le bâtiment. Les murs (Hydrogène): L'hydrogène est l'élément le plus abondant dans la maison. Il est présent un peu partout, comme les murs qui définissent les pièces. Il relie les différents éléments entre eux et contribue à la stabilité de la structure. Le toit (Oxygène): L'oxygène, souvent associé à l'eau, joue un rôle essentiel dans la protection de la maison. Il forme une partie du groupe carboxyle (-COOH), un peu comme un toit qui protège l'intérieur de la maison des intempéries. La porte d'entrée (Azote): L'azote est l'élément qui permet l'entrée et la sortie de la maison. Il fait partie du groupe amine (-NH2), qui peut former des liaisons avec d'autres molécules, un peu comme une porte qui permet des échanges avec l'extérieur. La cave (Soufre): Le soufre est moins présent, mais il joue un rôle important dans certaines maisons. Il est souvent situé dans la cave, un endroit plus caché. De même, le soufre est présent dans certains acides aminés spécifiques et leur confère des propriétés particulières. En résumé, chaque élément joue un rôle crucial dans la construction de cette maison-acide aminé. Le carbone forme la structure de base, l'hydrogène assure la cohésion, l'oxygène protège, l'azote permet les interactions et le soufre apporte des propriétés spécifiques. Cette analogie permet de visualiser comment ces différents atomes s'assemblent pour former une molécule complexe et fonctionnelle, l'acide aminé. (FLP) - Que serait l'eau ici ? (Gemini) - L'eau joue un rôle crucial dans la biologie, et notamment dans la structure des protéines. Pour l'intégrer à notre analogie de la maison, nous pourrions lui attribuer plusieurs rôles : 1. Le ciment: L'eau est essentielle à la formation des liaisons hydrogène, qui sont comme le ciment qui lie les briques (les acides aminés) entre elles pour former la structure de la protéine. Sans eau, ces liaisons ne pourraient se former, et la protéine ne pourrait adopter sa forme fonctionnelle. 2. Le solvant: L'eau est le solvant universel dans lequel se déroulent la plupart des réactions biologiques. Dans notre analogie, elle serait comme le sol sur lequel la maison est construite. Elle permet aux différents éléments de se déplacer et d'interagir les uns avec les autres. 3. Le système de plomberie: L'eau est essentielle au transport de substances à l'intérieur de la cellule. Elle pourrait être comparée au système de plomberie d'une maison, qui permet de distribuer l'eau et les nutriments dans toutes les pièces. 4. Le climatiseur: L'eau joue un rôle important dans la régulation de la température. Elle pourrait être comparée à un climatiseur qui maintient une température constante à l'intérieur de la maison. En résumé, l'eau est indispensable à la vie et joue un rôle multifacette dans la structure et la fonction des protéines. Dans notre analogie, elle est à la fois le ciment, le solvant, le système de plomberie et le climatiseur de notre maison-protéine.

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mécanisme biologique

Les molécules de protéines sont le nec plus ultra de la vie. Si l'on considère la cellule comme étant analogue à une usine, alors les protéines peuvent être considérées comme analogues aux machines d'une usine qui réalisent individuellement ou en groupes toutes les activités essentielles dont dépend la vie de la cellule. Chaque protéine est une sorte de machine micro-miniaturisée, si petite qu'elle doit être agrandie un million de fois avant d'être visible à l'œil humain. La structure et le fonctionnement de ces fascinantes unités de travail de la cellule sont restés un mystère complet jusqu'aux années 1950.

Auteur: Denton Michael J.

Info: L'évolution : Une théorie en crise. Chapitre 10 (p. 234) Adler & Adler. Bethesda, Maryland, États-Unis. 1986

[ nanomonde ] [ peptides ]

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mécanisme biologique

Lorsqu'un certain nombre d'enzymes sont nécessaires à l'assemblage d'un composé particulier, elles sont disposées les unes à côté des autres de sorte qu'après chaque étape de l'opération, le composé partiellement terminé puisse être facilement transmis à l'enzyme suivante qui effectue la prochaine opération chimique et ainsi de suite jusqu'à ce que le composé soit assemblé de manière définitive. Le procédé est si efficace que certains composés peuvent être assemblés en moins d'une seconde, alors que dans de nombreux cas, les mêmes opérations de synthèse effectuées par des chimistes, même dans un laboratoire bien équipé, prendraient plusieurs heures, des jours, voire des semaines.

Auteur: Denton Michael J.

Info: L'évolution : Une théorie en crise. Chapitre 14 (p. 334) Adler & Adler. Bethesda, Maryland, États-Unis. 1986

[ efficience ] [ catalyseurs ribonucléiques ]

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épistémologie

La théorie phlogistique* était une inversion de la véritable nature de la combustion. Enlever le phlogiston revenait en réalité à ajouter de l'oxygène, tandis qu'ajouter du phlogiston revenait en fait à enlever de l'oxygène. La théorie était une déformation totale de la réalité. Le phlogiston n'existait même pas, et pourtant son existence a été fermement crue et la théorie a été rigoureusement respectée pendant près de cent ans au cours du dix-huitième siècle. ... Au fil des expériences, les propriétés du phlogistique sont devenues de plus en plus bizarres et contradictoires. Mais au lieu de remettre en question l'existence de cette substance mystérieuse, on la fit servir à des fins plus générales. ... Pour le sceptique ou, en fait, pour quiconque est prêt à sortir du cercle des croyances darwiniennes, il n'est pas difficile de trouver dans la pensée évolutionniste moderne des inversions du sens commun qui rappellent de façon frappante la gymnastique mentale des chimistes du phlogistique ou des astronomes médiévaux.

Pour le sceptique, la proposition selon laquelle les programmes génétiques des organismes supérieurs, composés d'environ mille millions de bits d'information, équivalant à la séquence de lettres dans une petite bibliothèque de mille volumes, contenant sous forme codée d'innombrables milliers d'informations. Des algorithmes complexes contrôlant, spécifiant et ordonnant la croissance et le développement de milliards et de milliards de cellules sous la forme d'un organisme complexe, ont été composés par un processus purement aléatoire, est tout simplement un affront à la raison. Mais pour le darwiniste, l'idée est acceptée sans le moindre doute - c'est le paradigme qui premier !

Auteur: Denton Michael J.

Info: Evolution : Une théorie en crise - * était censé être une substance invisible contenue dans les objets qui brûlaient. Lors de la combustion, cette substance (phlogistique) était libérée, ce qui produisait chaleur et lumière. Cette théorie a été abandonnée après que Lavoisier ait découvert que la combustion était en fait une réaction chimique avec l'oxygène de l'air.

[ sciences ] [ schéma directeur ] [ cadre général ] [ sérendipité ]

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