biologie

Les structures et les séquences moléculaires sont généralement plus révélatrices des relations évolutives que les phénotypes classiques (en particulier chez les micro-organismes). Par conséquent, la base de la définition des taxons s'est progressivement déplacée du niveau de l'organisme au niveau cellulaire puis au niveau moléculaire. Les comparaisons moléculaires montrent que la vie sur cette planète se divise en trois groupes principaux, communément appelés les bactéries, les archaebactéries et les eucaryotes. Les trois sont très dissemblables, les différences qui les séparent étant d'une nature plus profonde que les différences qui séparent les règnes typiques, tels que les animaux et les plantes. Malheureusement, aucun des points de vue conventionnellement acceptés sur les relations naturelles entre les systèmes vivants - c'est-à-dire la taxonomie des cinq royaumes de Whittaker (Animalia, Plantae, Champignons, Protiste, bactéries), ou la dichotomie eucaryote-procaryote - ne reflète cette division primaire tripartite du monde vivant. Pour remédier à cette situation, nous proposons qu'un système formel d'organismes soit établi dans lequel, au-dessus du niveau du règne, existe un nouveau taxon appelé "domaine". La vie sur cette planète serait alors considérée comme comprenant trois domaines, les Bactéries, les Archées et les Eucarya, chacun contenant deux royaumes ou plus. (L'Eucarya, par exemple, contient Animalia, Plantae, Fungi, et un certain nombre d'autres encore à définir). Bien que la structure taxonomique au sein des Bactéries et Eucarya ne soit pas traitée ici,

Auteur: Woese Carl

Info: Avec O Kandler, ML Wheelis (1990). "Vers un système naturel d'organismes : proposition pour les domaines Archaea, Bacteria, et Eucarya. (PDF)". Actes de l'Académie nationale des sciences des États-Unis d'Amérique 87 (12): 4576–4579.

[ arbre du vivant ] [ réorganisé ] [ triade ] [ phylogenèse ] [ cladistique ] [ historique ]

microbiote

Il me semble clair que si on supprimait toutes les formes de vie multicellulaires de la surface de la terre, la vie microbienne changerait éventuellement un petit peu, mais si la vie microbienne devait disparaître, serait la fin - la mort instantanée de la planète.

Auteur: Woese Carl

Info:

[ essentiel ]

prana

Dans sa forme la plus primitive, la vie n'est donc plus liée à la cellule, la cellule qui possède une structure et qui peut être comparée à un rouage complexe, comme une montre qui cesse d'exister si on la frappe dans un mortier. Non, dans sa forme primitive, la vie est comme le feu, comme une flamme portée par la substance vivante, comme une flamme qui apparaît dans une diversité infinie et qui a pourtant une spécificité en elle, qui peut prendre la forme du monde organique, de la feuille d'herbe blanche et de la tige de l'arbre.

Auteur: Beijerinck Martinus Willem

Info: Discours prononcé lors de la réunion de 1913 de la Koninklijke Akademie van Wetenschappen à Amsterdam. Trans. dans G. Van Iterson, Jr, L. E. Den Dooren De Jong et A. J. Kluyver, Martinus Willem Beilerinck : His Life and Work (1940), 120.

[ fluide vital ] [ source ]

monades

Les organismes sont des structures résilientes et flexibles, intégrées dans un flux turbulent.

Auteur: Woese Carl

Info:

[ définies ]

humour

Je ne suis pas athée. Comment peut-on ne pas croire en quelque chose qui n'existe pas ? C'est beaucoup trop compliqué pour moi.

 

Auteur: Woese Carl

Info:

[ dévot ]

dogmatisme

Ce qui rend le traitement de l'évolution par les biologistes du siècle dernier insupportable d'un point de vue scientifique n'est pas la synthèse moderne en soi. C'est plutôt le fait que la biologie moléculaire en ait accepté la synthèse comme une théorie complète sans poser de questions, donnant ainsi l'impression que l'évolution était essentiellement un problème scientifique résolu dont les racines se trouvaient uniquement dans le paradigme moléculaire.

Auteur: Woese Carl

Info: How the Microbial World Saved Evolution from the Scylla of Molecular Biology and the Charybdis of the Modern Synthesis, avec Nigel Goldenfeld Microbiol Mol Biol Rev. 2009 Mar; 73(1): 14–21.

[ certitude ] [ fermeture ]

ouverture

Il ne doit pas y avoir d'obstacles à la liberté de recherche. Le dogme n'a pas sa place en science. Le scientifique est libre et doit être libre de poser n'importe quelle question, de douter de n'importe quelle affirmation, de rechercher n'importe quelle preuve, de corriger n'importe quelle erreur.

Auteur: Oppenheimer Julius Robert

Info: The Open Mind, p. 114 (1955)

[ indépendance ] [ horizontalité ]

biologie

Aucune phylogénie cohérente d'organisme n'a émergé des nombreuses phylogénies de protéines individuelles produites jusqu'à présent. 

Auteur: Woese Carl

Info:

[ discontinuité ] [ chaînon manquant ] [ évolution ] [ incompréhensible ] [ nano-monde ]

biologie

Les incongruités phylogénétiques sont visibles partout dans l'arbre universel, depuis sa racine jusqu'aux principales ramifications à l'intérieur et entre les différents taxons, en passant par la composition des groupes primaires eux-mêmes.

Auteur: Woese Carl

Info:

[ mise en question ]

évolutionnisme

Aujourd'hui, nous savons que le transfert horizontal de gènes est une force évolutive puissante dans le monde microbien, bien documentée dans les archives phylogénétiques, et dont l'importance écologique commence seulement à être pleinement comprise. Stimulée par les progrès de la technologie génomique, l'écologie microbienne offre de nouvelles perspectives sur le fonctionnement de la biosphère, exigeant une synthèse avec le processus évolutif et obligeant la biologie évolutive à s'intéresser à la question. Le pouvoir du transfert horizontal de gènes est si grand qu'il est difficile de comprendre pourquoi le monde eucaryote tournerait le dos à une source aussi merveilleuse de nouveauté et d'innovation génétiques. La réponse passionnante, qui fait éclater des décennies de préjugés dogmatiques, est que ce n'est pas le cas. Il existe aujourd'hui des preuves irréfutables du transfert horizontal de gènes chez les eucaryotes, non seulement chez les plantes, les protistes et les champignons, mais aussi chez les animaux (y compris les mammifères). Les implications évolutives n'ont pas encore été étudiées, mais nous sommes convaincus qu'une théorie pleinement élaborée du processus évolutif est nécessaire pour relever correctement les défis posés initialement par la microbiologie.

Auteur: Woese Carl

Info: How the Microbial World Saved Evolution from the Scylla of Molecular Biology and the Charybdis of the Modern Synthesis", Microbiology and Molecular Biology Reviews - 2009, avec Nigel Goldenfeld.

[ transversal ]